L'Ordre est administré par un conseil d'administration de 24 membres. Pour l'aider à assurer le bon fonctionnement de l'Ordre, le Conseil crée des comités ayant chacun une mission bien précise, définie par le Code des professions ou par le Conseil lui-même.
L'Ordre comprend six sections régionales - Centre-Québec, Estrie, Montréal, Outaouais, Québec et Saguenay-Lac-Saint-Jean - et deux conseils régionaux actifs, Est du Québec et Abitibi-Témiscamingue. Ils assurent la présence de l'Ordre en région et contribuent de façon significative au rayonnement de la profession, tant dans le milieu des maisons d'enseignement postsecondaire qu'auprès des employeurs. Quant aux comités étudiants, ils sont composés de jeunes qui représentent très activement l'Ordre en milieu universitaire. Le fonctionnigramme illustre la structure d'organisation de l'Ordre.
Le personnel permanent, formé de près d'une quarantaine de personnes, est dirigé par le président-directeur général. L'organigramme illustre le partage des responsabilités du personnel.